BASF предоставляет научно-исследовательским группам бесплатный доступ к собственной базе субстанций с несколькими миллионами записей

BASF оказывает поддержку мировым научно-исследовательским группам, которые ведут поиск активного вещества для лечения инфицированных коронавирусом пациентов. «Мы не разрабатываем активные фармацевтические ингредиенты, однако BASF уже более 150 лет исследует различные субстанции. Поэтому мы накопили достаточно знаний, а также создали внушительную базу активных веществ», – комментирует Питер Эккс, президент подразделения биологических исследований концерна BASF. 

Концерн разработал ряд компьютерных программ для моделирования молекул, а также располагает собственным суперкомпьютером под названием Quriosity.

«Использование этих колоссальных исследовательских возможностей для нас ещё один способ внести свой вклад в борьбу с коронавирусом», – продолжает Питер Эккс.

В работе BASF использует несколько подходов. Чтобы оперативно выявить подходящее активное вещество против SARS-CoV-2, научные лаборатории по всему миру проверяют на клеточных культурах эффективность препаратов, уже одобренных для лечения других вирусных заболеваний. Однако эти препараты могут быть недостаточно эффективны, поэтому необходимо искать новые вещества, производные от существующих. С помощью суперкомпьютера исследователи BASF провели поиск среди нескольких миллионов молекул, которые содержатся в базе концерна. В результате было обнаружено 150 подходящих молекул, которые BASF предоставил научно-исследовательским группам бесплатно, без притязания на выдачу патента.

Сотрудники из подразделения вычислительной химии предложили ещё один подход к борьбе с коронавирусом. Они узнали о проекте COVID-19 Moonshot стартапа PostEra, в рамках которого учёные по всему миру на добровольных началах помогают найти вещество, которое подавляет развитие основной вирусной протеазы, жизненно важного фермента вируса. Исследователи BASF присоединились к совместным поискам и с помощью суперкомпьютера Quriosity и специальной программы уже разработали множество новых молекул. Таким образом было открыто 20 веществ, молекулы которых в рамках компьютерной модели смогли встроиться в активный участок фермента вируса. Разработки были переданы проекту COVID-19 Moonshot бесплатно для дальнейших исследований.

«К сожалению, не всегда удаётся быстро определить, получится ли синтезировать молекулы, смоделированные компьютером», – комментирует  профессор Клаус-Юрген Шляйфер, руководитель подразделения исследований цифровой биологии концерна BASF. Исследователи BASF работают и над этой проблемой. С помощью суперкомпьютера были протестированы все соединения, которые в принципе могут быть синтезированы кем-либо из производителей, участвующих в проекте COVID-19 Moonshot. «Речь идёт примерно о 1,2 млрд возможных соединений», – пояснил Шлейфер. Преимущество подхода в том, что подходящие молекулы могут быть синтезированы очень быстро, а затем переданы для дальнейших экспериментов. BASF в рамках проекта сделает результаты своих изысканий общедоступными.

Помощь ученым в поиске активного ингредиента – только одна из ряда инициатив кампании «Руки помощи». Концерн выделил более 100 млн евро на борьбу с пандемией.

Источник